Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cds1P98191 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cds1P98191 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cds1P98191 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cds1P98191 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cds1P98191 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cds1P98191 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cds1P98191 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cds1P98191 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cds1P98191 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms