Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cry1P97784 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cry1P97784 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cry1P97784 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cry1P97784 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cry1P97784 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cry1P97784 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cry1P97784 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cry1P97784 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cry1P97784 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cry1P97784 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cry1P97784 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry1P97784 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cry1P97784 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cry1P97784 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms