Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad4P97471 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smad4P97471 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad4P97471 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad4P97471 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad4P97471 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad4P97471 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad4P97471 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad4P97471 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad4P97471 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad4P97471 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad4P97471 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms