Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smyd1P97443 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd1P97443 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd1P97443 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd1P97443 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd1P97443 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd1P97443 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd1P97443 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd1P97443 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd1P97443 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd1P97443 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smyd1P97443 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smyd1P97443 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smyd1P97443 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smyd1P97443 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smyd1P97443 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smyd1P97443 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smyd1P97443 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smyd1P97443 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smyd1P97443 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms