Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mesp1P97309 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mesp1P97309 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms