Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H3f3aP84244 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3f3aP84244 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3f3aP84244 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3f3aP84244 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H3f3aP84244 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms