Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbx1P82976 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbx1P82976 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gbx1P82976 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gbx1P82976 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbx1P82976 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbx1P82976 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbx1P82976 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbx1P82976 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbx1P82976 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbx1P82976 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbx1P82976 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbx1P82976 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbx1P82976 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbx1P82976 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbx1P82976 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbx1P82976 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbx1P82976 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gbx1P82976 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms