Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf3P70671 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf3P70671 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf3P70671 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf3P70671 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf3P70671 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf3P70671 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf3P70671 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Irf3P70671 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf3P70671 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf3P70671 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf3P70671 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf3P70671 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms