Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Msx3P70354 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msx3P70354 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msx3P70354 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msx3P70354 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msx3P70354 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msx3P70354 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msx3P70354 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msx3P70354 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Msx3P70354 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msx3P70354 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms