Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Gfi1P70338 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfi1P70338 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms