Protein–RNA interactions for Protein: P70335

Rock1, Rho-associated protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rock1P70335 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rock1P70335 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Rock1P70335 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Rock1P70335 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rock1P70335 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rock1P70335 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rock1P70335 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Rock1P70335 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rock1P70335 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rock1P70335 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rock1P70335 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rock1P70335 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rock1P70335 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rock1P70335 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rock1P70335 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rock1P70335 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rock1P70335 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rock1P70335 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Rock1P70335 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rock1P70335 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rock1P70335 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rock1P70335 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rock1P70335 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rock1P70335 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rock1P70335 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rock1P70335 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rock1P70335 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rock1P70335 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rock1P70335 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rock1P70335 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rock1P70335 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rock1P70335 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rock1P70335 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rock1P70335 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rock1P70335 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Rock1P70335 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rock1P70335 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms