Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tgif1P70284 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgif1P70284 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgif1P70284 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgif1P70284 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgif1P70284 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgif1P70284 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgif1P70284 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgif1P70284 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgif1P70284 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgif1P70284 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgif1P70284 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgif1P70284 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgif1P70284 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgif1P70284 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgif1P70284 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgif1P70284 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgif1P70284 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgif1P70284 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tgif1P70284 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgif1P70284 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms