Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad54lP70270 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad54lP70270 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad54lP70270 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad54lP70270 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad54lP70270 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad54lP70270 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad54lP70270 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad54lP70270 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rad54lP70270 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rad54lP70270 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad54lP70270 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms