Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxd13P70217 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd13P70217 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd13P70217 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd13P70217 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms