Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SbdsP70122 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SbdsP70122 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SbdsP70122 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SbdsP70122 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SbdsP70122 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SbdsP70122 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SbdsP70122 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SbdsP70122 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SbdsP70122 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SbdsP70122 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SbdsP70122 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms