Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgb1P63158 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hmgb1P63158 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb1P63158 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms