Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnb1P62874 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnb1P62874 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnb1P62874 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnb1P62874 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnb1P62874 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnb1P62874 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnb1P62874 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnb1P62874 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gnb1P62874 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gnb1P62874 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gnb1P62874 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gnb1P62874 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gnb1P62874 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gnb1P62874 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gnb1P62874 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms