Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl23aP62751 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl23aP62751 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms