Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lrch1P62046 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrch1P62046 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrch1P62046 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms