Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme3P61290 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme3P61290 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme3P61290 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme3P61290 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme3P61290 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme3P61290 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme3P61290 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme3P61290 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme3P61290 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme3P61290 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme3P61290 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme3P61290 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme3P61290 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme3P61290 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psme3P61290 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme3P61290 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms