Protein–RNA interactions for Protein: P60843

Eif4a1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif4a1P60843 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Eif4a1P60843 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Eif4a1P60843 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Eif4a1P60843 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Eif4a1P60843 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Eif4a1P60843 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Eif4a1P60843 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Eif4a1P60843 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Eif4a1P60843 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Eif4a1P60843 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Eif4a1P60843 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Eif4a1P60843 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms