Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Polr3bP59470 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr3bP59470 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr3bP59470 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms