Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp20P57748 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mmp20P57748 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mmp20P57748 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mmp20P57748 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp20P57748 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms