Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp25P57080 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp25P57080 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp25P57080 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp25P57080 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp25P57080 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp25P57080 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms