Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TdgP56581 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TdgP56581 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TdgP56581 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TdgP56581 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TdgP56581 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TdgP56581 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TdgP56581 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TdgP56581 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TdgP56581 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TdgP56581 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TdgP56581 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TdgP56581 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TdgP56581 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TdgP56581 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TdgP56581 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TdgP56581 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TdgP56581 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TdgP56581 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TdgP56581 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TdgP56581 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TdgP56581 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TdgP56581 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TdgP56581 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TdgP56581 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TdgP56581 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TdgP56581 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TdgP56581 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TdgP56581 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TdgP56581 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TdgP56581 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TdgP56581 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TdgP56581 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TdgP56581 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TdgP56581 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TdgP56581 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TdgP56581 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TdgP56581 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TdgP56581 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TdgP56581 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TdgP56581 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TdgP56581 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TdgP56581 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TdgP56581 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TdgP56581 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TdgP56581 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TdgP56581 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TdgP56581 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TdgP56581 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TdgP56581 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TdgP56581 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TdgP56581 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TdgP56581 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TdgP56581 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TdgP56581 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TdgP56581 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TdgP56581 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TdgP56581 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TdgP56581 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TdgP56581 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TdgP56581 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TdgP56581 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TdgP56581 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TdgP56581 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TdgP56581 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TdgP56581 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TdgP56581 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TdgP56581 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TdgP56581 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TdgP56581 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TdgP56581 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TdgP56581 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TdgP56581 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TdgP56581 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TdgP56581 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TdgP56581 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TdgP56581 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TdgP56581 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TdgP56581 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TdgP56581 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TdgP56581 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TdgP56581 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TdgP56581 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TdgP56581 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TdgP56581 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TdgP56581 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TdgP56581 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TdgP56581 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TdgP56581 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TdgP56581 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TdgP56581 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TdgP56581 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TdgP56581 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TdgP56581 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TdgP56581 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TdgP56581 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TdgP56581 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TdgP56581 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TdgP56581 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TdgP56581 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms