Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ctbp2P56546 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctbp2P56546 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctbp2P56546 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctbp2P56546 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms