Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox17P56394 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox17P56394 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox17P56394 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox17P56394 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox17P56394 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox17P56394 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox17P56394 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox17P56394 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox17P56394 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox17P56394 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms