Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atp5eP56382 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atp5eP56382 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms