Protein–RNA interactions for Protein: P54276

Msh6, DNA mismatch repair protein Msh6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh6P54276 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Msh6P54276 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Msh6P54276 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Msh6P54276 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Msh6P54276 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Msh6P54276 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Msh6P54276 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Msh6P54276 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Msh6P54276 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Msh6P54276 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Msh6P54276 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Msh6P54276 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Msh6P54276 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Msh6P54276 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Msh6P54276 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Msh6P54276 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Msh6P54276 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Msh6P54276 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Msh6P54276 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Msh6P54276 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Msh6P54276 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Msh6P54276 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Msh6P54276 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Msh6P54276 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Msh6P54276 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Msh6P54276 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Msh6P54276 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Msh6P54276 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Msh6P54276 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Msh6P54276 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Msh6P54276 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Msh6P54276 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Msh6P54276 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Msh6P54276 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Msh6P54276 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Msh6P54276 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Msh6P54276 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Msh6P54276 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Msh6P54276 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Msh6P54276 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Msh6P54276 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Msh6P54276 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Msh6P54276 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Msh6P54276 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Msh6P54276 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms