Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Epb41l4aP52963 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Epb41l4aP52963 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Epb41l4aP52963 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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