Protein–RNA interactions for Protein: P51791

Clcn3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3P51791 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clcn3P51791 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn3P51791 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.1 ms