Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccr5P51682 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccr5P51682 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccr5P51682 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms