Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MipP51180 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MipP51180 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MipP51180 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MipP51180 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MipP51180 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MipP51180 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MipP51180 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MipP51180 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MipP51180 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MipP51180 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MipP51180 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MipP51180 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MipP51180 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MipP51180 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MipP51180 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MipP51180 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MipP51180 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MipP51180 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MipP51180 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MipP51180 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MipP51180 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MipP51180 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MipP51180 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MipP51180 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MipP51180 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MipP51180 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MipP51180 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MipP51180 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MipP51180 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MipP51180 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MipP51180 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MipP51180 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MipP51180 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MipP51180 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MipP51180 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MipP51180 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MipP51180 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MipP51180 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MipP51180 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MipP51180 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MipP51180 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MipP51180 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MipP51180 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MipP51180 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MipP51180 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MipP51180 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MipP51180 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MipP51180 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MipP51180 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MipP51180 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MipP51180 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MipP51180 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MipP51180 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MipP51180 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MipP51180 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MipP51180 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MipP51180 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MipP51180 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MipP51180 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MipP51180 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MipP51180 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MipP51180 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MipP51180 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MipP51180 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MipP51180 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MipP51180 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MipP51180 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MipP51180 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MipP51180 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MipP51180 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MipP51180 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MipP51180 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MipP51180 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MipP51180 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MipP51180 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MipP51180 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MipP51180 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MipP51180 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MipP51180 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MipP51180 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MipP51180 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MipP51180 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MipP51180 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MipP51180 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MipP51180 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MipP51180 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MipP51180 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MipP51180 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MipP51180 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MipP51180 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MipP51180 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MipP51180 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MipP51180 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MipP51180 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MipP51180 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MipP51180 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MipP51180 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MipP51180 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MipP51180 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms