Protein–RNA interactions for Protein: P50711

Defa13, Alpha-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa13P50711 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa13P50711 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa13P50711 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa13P50711 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa13P50711 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa13P50711 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa13P50711 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa13P50711 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa13P50711 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa13P50711 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa13P50711 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa13P50711 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms