Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TspoP50637 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TspoP50637 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TspoP50637 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TspoP50637 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TspoP50637 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TspoP50637 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TspoP50637 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TspoP50637 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TspoP50637 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TspoP50637 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TspoP50637 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TspoP50637 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TspoP50637 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TspoP50637 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TspoP50637 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TspoP50637 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TspoP50637 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TspoP50637 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TspoP50637 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TspoP50637 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TspoP50637 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TspoP50637 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TspoP50637 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TspoP50637 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TspoP50637 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TspoP50637 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TspoP50637 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TspoP50637 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TspoP50637 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TspoP50637 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TspoP50637 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TspoP50637 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TspoP50637 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TspoP50637 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TspoP50637 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TspoP50637 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TspoP50637 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TspoP50637 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TspoP50637 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TspoP50637 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TspoP50637 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TspoP50637 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TspoP50637 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TspoP50637 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TspoP50637 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TspoP50637 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TspoP50637 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TspoP50637 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TspoP50637 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TspoP50637 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TspoP50637 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TspoP50637 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TspoP50637 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TspoP50637 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TspoP50637 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TspoP50637 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TspoP50637 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TspoP50637 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TspoP50637 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TspoP50637 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TspoP50637 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TspoP50637 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TspoP50637 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TspoP50637 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TspoP50637 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TspoP50637 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TspoP50637 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TspoP50637 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TspoP50637 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TspoP50637 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TspoP50637 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TspoP50637 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TspoP50637 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TspoP50637 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TspoP50637 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TspoP50637 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TspoP50637 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TspoP50637 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TspoP50637 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TspoP50637 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TspoP50637 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TspoP50637 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TspoP50637 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TspoP50637 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TspoP50637 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TspoP50637 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TspoP50637 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TspoP50637 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TspoP50637 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TspoP50637 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TspoP50637 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TspoP50637 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TspoP50637 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TspoP50637 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TspoP50637 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TspoP50637 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TspoP50637 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TspoP50637 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TspoP50637 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms