Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtpreP49446 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpreP49446 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpreP49446 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpreP49446 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpreP49446 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PtpreP49446 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpreP49446 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpreP49446 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpreP49446 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpreP49446 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpreP49446 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PtpreP49446 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpreP49446 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PtpreP49446 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpreP49446 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms