Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbp3P49194 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rbp3P49194 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbp3P49194 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms