Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox8bP48772 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms