Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcd1P48410 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms