Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rfx1P48377 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rfx1P48377 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rfx1P48377 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms