Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VdrP48281 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VdrP48281 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VdrP48281 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VdrP48281 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VdrP48281 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VdrP48281 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VdrP48281 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VdrP48281 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VdrP48281 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VdrP48281 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VdrP48281 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VdrP48281 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VdrP48281 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VdrP48281 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VdrP48281 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VdrP48281 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VdrP48281 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VdrP48281 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VdrP48281 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VdrP48281 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VdrP48281 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VdrP48281 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VdrP48281 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VdrP48281 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VdrP48281 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VdrP48281 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VdrP48281 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VdrP48281 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VdrP48281 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VdrP48281 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VdrP48281 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VdrP48281 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VdrP48281 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VdrP48281 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VdrP48281 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VdrP48281 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VdrP48281 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VdrP48281 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VdrP48281 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VdrP48281 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VdrP48281 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VdrP48281 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VdrP48281 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VdrP48281 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VdrP48281 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VdrP48281 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VdrP48281 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VdrP48281 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VdrP48281 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VdrP48281 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VdrP48281 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VdrP48281 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VdrP48281 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VdrP48281 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VdrP48281 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VdrP48281 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VdrP48281 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VdrP48281 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VdrP48281 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VdrP48281 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VdrP48281 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VdrP48281 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VdrP48281 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VdrP48281 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VdrP48281 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VdrP48281 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VdrP48281 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VdrP48281 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VdrP48281 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VdrP48281 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VdrP48281 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VdrP48281 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VdrP48281 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VdrP48281 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VdrP48281 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VdrP48281 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VdrP48281 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VdrP48281 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VdrP48281 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VdrP48281 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VdrP48281 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VdrP48281 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VdrP48281 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VdrP48281 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VdrP48281 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VdrP48281 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VdrP48281 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VdrP48281 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VdrP48281 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VdrP48281 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VdrP48281 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VdrP48281 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VdrP48281 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VdrP48281 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VdrP48281 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VdrP48281 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VdrP48281 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VdrP48281 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VdrP48281 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms