Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax9P47242 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax9P47242 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax9P47242 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax9P47242 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax9P47242 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax9P47242 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax9P47242 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax9P47242 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax9P47242 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax9P47242 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax9P47242 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms