Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pax7P47239 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax7P47239 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax7P47239 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax7P47239 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax7P47239 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax7P47239 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pax7P47239 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pax7P47239 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax7P47239 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax7P47239 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pax7P47239 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pax7P47239 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms