Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stt3aP46978 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stt3aP46978 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stt3aP46978 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178 ms