Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11bP46638 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab11bP46638 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11bP46638 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms