Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syt1P46096 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syt1P46096 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syt1P46096 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syt1P46096 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syt1P46096 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syt1P46096 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syt1P46096 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syt1P46096 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Syt1P46096 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syt1P46096 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syt1P46096 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syt1P46096 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syt1P46096 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syt1P46096 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syt1P46096 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syt1P46096 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syt1P46096 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syt1P46096 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syt1P46096 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Syt1P46096 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syt1P46096 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syt1P46096 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syt1P46096 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syt1P46096 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms