Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clec3bP43025 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clec3bP43025 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec3bP43025 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms