Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pbx1P41778 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbx1P41778 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pbx1P41778 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms