Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Grin2aP35436 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Grin2aP35436 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Grin2aP35436 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Grin2aP35436 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Grin2aP35436 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Grin2aP35436 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Grin2aP35436 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Grin2aP35436 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Grin2aP35436 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Grin2aP35436 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Grin2aP35436 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Grin2aP35436 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Grin2aP35436 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Grin2aP35436 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Grin2aP35436 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Grin2aP35436 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Grin2aP35436 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Grin2aP35436 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Grin2aP35436 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Grin2aP35436 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Grin2aP35436 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Grin2aP35436 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Grin2aP35436 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Grin2aP35436 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Grin2aP35436 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Grin2aP35436 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms