Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab20P35295 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab20P35295 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab20P35295 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab20P35295 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab20P35295 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab20P35295 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab20P35295 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab20P35295 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab20P35295 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab20P35295 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab20P35295 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab20P35295 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab20P35295 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab20P35295 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab20P35295 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab20P35295 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab20P35295 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms